Systematic name | CopciAB_365333 | Strain | Coprinopsis cinerea Okayama 7 |
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Standard name | - | Synonyms | 365333 |
Uniprot id | Functional description | other AgaK1 protein kinase | |
Location | scaffold_7:2058276..2060004 | Strand | + |
Gene length (nt) | 1729 | Transcript length (nt) | 1495 |
CDS length (nt) | 1152 | Protein length (aa) | 383 |
Strain name | Gene / Protein name |
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Strain name | Gene / Protein name | Pident | E-value | Bits |
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Ganoderma sp. 10597 SS1 v1.0 | Gansp1_65481 | 39.4 | 1.361E-83 | 281 |
Lentinula edodes NBRC 111202 | Lenedo1_1065852 | 36.6 | 1.528E-71 | 246 |
Lentinula edodes W1-26 v1.0 | Lentinedodes1_23193 | 36.6 | 1.516E-71 | 246 |
Auricularia subglabra | Aurde3_1_1240640 | 33.7 | 2.931E-54 | 196 |
Flammulina velutipes | Flave_chr05AA00209 | 40.9 | 3.822E-53 | 192 |
Name | Summary | Attribution | Assay type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Carbon metabolism | Transcriptional changes along alternative morphogenetic paths of C. cinerea | Xie et al. 2020 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Complex carbon sources 1 (long incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Coprinopsis challenged with bacteria | Transcriptional response to Bacillus subtilis and Escherichia coli. | Kombrink et al. 2018 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Early development 1 | Time series expression profiling of basidiospore and oidium germination | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Early development 2 | Time series expression profiling of mycelial growth, light induction and fruiting body initiation. | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Fruiting body development | RNA-Seq analysis of fruiting body development | Krizsan et al. 2019 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Nitrogen sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Plant biomass (12h incubation) | Expression profiling on diverse plant biomasses as carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Simple and complex carbon and nitrogen sources | Expression profiling on diverse complex carbon and nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Simple and complex carbon sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Starvation induced by water agar transfer | Expression profiling on starvation induced by transfer to water agar | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Straw time series | Time series expression profiling on straw as a carbon source | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Stress conditions 1 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Stress conditions 2 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Systematic name | - |
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Protein id | CopciAB_365333.T0 |
Description | other AgaK1 protein kinase |
Analysis | Signature accession | Signature description | InterPro Accession | Start | End |
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No records |
Prediction | Start | End | Score |
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No records |
Domain n | Start | End | Length |
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No records |
Accession | Description |
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IPR011009 | Protein kinase-like domain superfamily |
IPR000719 | Protein kinase domain |
Go id | Term | Ontology |
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GO:0004672 | protein kinase activity | MF |
GO:0005524 | ATP binding | MF |
GO:0006468 | protein phosphorylation | BP |
KEGG Orthology |
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No records |
COG category | Description |
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G | other AgaK1 protein kinase |
Class | Family | Subfamily |
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No records |
Group |
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No records |
Arrow shows the origin of gene family containing CopciAB_365333.
Sequence id | CopciAB_365333.T0 |
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Sequence |
>CopciAB_365333.T0 MGVFDELGRSEVYWRDHYEWFKEQGFELRARYKPGWIPSWKTDPTLKPGLSEDSEMFNRSHLNDATRIADGKHVV LKRIEKSQYPEEVSILRYFSEKPLASNPENHCVPVLAVLNPPDDPEHDIAVLPILRDYDDPPFETIGEVVDYIGQ ILEGFVFLHEHRVAHRDVRRDNIMMDPHAMGHSSWHFVCPEKTRDYRSEVTHKYTRTERRPRYYIIDFGYSAQFK PEEMPPSTLPKPASDTSLPEYNNLWKPCDPFPIDVYVVGNMIRMDFLDGYPKEGFLSYRHCEKMPSTKRLEFLRP LIDAMIKENPNERVTMKEAFSLFNDIVSKVGNSTLRRRPDVLGGLPRHEWFYERIANTASHWYKTMRCVICRIPP IPRERTAP |
Length | 383 |
Sequence id | CopciAB_365333.T0 |
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Sequence |
>CopciAB_365333.T0 ATGGGTGTTTTCGACGAACTTGGTCGATCCGAGGTCTATTGGAGAGATCATTATGAATGGTTCAAGGAGCAGGGG TTTGAACTTCGAGCCCGCTATAAACCAGGGTGGATTCCCTCTTGGAAAACAGACCCCACCTTGAAGCCGGGGCTC AGCGAGGATTCGGAAATGTTCAATCGCAGCCACCTCAACGATGCTACCCGAATCGCCGACGGCAAGCACGTCGTT TTAAAACGAATCGAAAAGTCTCAATATCCAGAAGAAGTGTCTATCCTCAGGTATTTCTCAGAAAAACCACTTGCT TCCAACCCAGAGAACCATTGTGTTCCTGTTCTGGCGGTCTTGAACCCTCCTGACGACCCCGAGCACGACATTGCT GTCCTACCGATCTTACGGGATTACGACGACCCTCCTTTCGAAACCATTGGTGAGGTGGTCGACTACATCGGGCAG ATTCTAGAGGGATTCGTGTTCCTCCACGAACATCGTGTTGCACATCGAGATGTCCGAAGGGACAACATCATGATG GACCCTCATGCCATGGGCCACAGTTCATGGCATTTTGTCTGCCCCGAAAAGACGCGCGACTACAGGTCAGAAGTT ACTCACAAGTACACGCGCACCGAGCGTAGGCCAAGGTATTATATCATTGACTTTGGGTACTCTGCCCAGTTCAAA CCCGAGGAGATGCCGCCGTCGACTCTGCCAAAACCGGCCAGCGACACCAGCCTTCCTGAATATAACAATCTATGG AAGCCGTGCGATCCATTTCCGATCGATGTGTATGTCGTAGGAAATATGATTCGTATGGACTTTTTGGATGGCTAC CCGAAGGAAGGTTTCCTCAGCTATCGCCATTGCGAGAAGATGCCCAGCACAAAACGCCTTGAGTTTCTTCGACCG TTAATAGACGCGATGATTAAGGAGAACCCGAACGAAAGGGTCACGATGAAGGAGGCATTCTCTCTCTTTAACGAC ATCGTGTCAAAGGTTGGCAACAGTACGCTACGGCGTAGGCCTGACGTGCTTGGTGGGCTCCCTCGTCATGAGTGG TTTTACGAGCGCATCGCCAATACAGCCTCGCACTGGTACAAGACGATGCGTTGTGTCATTTGTAGGATTCCTCCC ATTCCGAGAGAACGCACGGCACCGTGA |
Length | 1152 |
Sequence id | CopciAB_365333.T0 |
---|---|
Sequence |
>CopciAB_365333.T0 ATCTCACTTTGAACACACTGTTGACGGACACCCGAGTCATGGGTGTTTTCGACGAACTTGGTCGATCCGAGGTCT ATTGGAGAGATCATTATGAATGGTTCAAGGAGCAGGGGTTTGAACTTCGAGCCCGCTATAAACCAGGGTGGATTC CCTCTTGGAAAACAGACCCCACCTTGAAGCCGGGGCTCAGCGAGGATTCGGAAATGTTCAATCGCAGCCACCTCA ACGATGCTACCCGAATCGCCGACGGCAAGCACGTCGTTTTAAAACGAATCGAAAAGTCTCAATATCCAGAAGAAG TGTCTATCCTCAGGTATTTCTCAGAAAAACCACTTGCTTCCAACCCAGAGAACCATTGTGTTCCTGTTCTGGCGG TCTTGAACCCTCCTGACGACCCCGAGCACGACATTGCTGTCCTACCGATCTTACGGGATTACGACGACCCTCCTT TCGAAACCATTGGTGAGGTGGTCGACTACATCGGGCAGATTCTAGAGGGATTCGTGTTCCTCCACGAACATCGTG TTGCACATCGAGATGTCCGAAGGGACAACATCATGATGGACCCTCATGCCATGGGCCACAGTTCATGGCATTTTG TCTGCCCCGAAAAGACGCGCGACTACAGGTCAGAAGTTACTCACAAGTACACGCGCACCGAGCGTAGGCCAAGGT ATTATATCATTGACTTTGGGTACTCTGCCCAGTTCAAACCCGAGGAGATGCCGCCGTCGACTCTGCCAAAACCGG CCAGCGACACCAGCCTTCCTGAATATAACAATCTATGGAAGCCGTGCGATCCATTTCCGATCGATGTGTATGTCG TAGGAAATATGATTCGTATGGACTTTTTGGATGGCTACCCGAAGGAAGGTTTCCTCAGCTATCGCCATTGCGAGA AGATGCCCAGCACAAAACGCCTTGAGTTTCTTCGACCGTTAATAGACGCGATGATTAAGGAGAACCCGAACGAAA GGGTCACGATGAAGGAGGCATTCTCTCTCTTTAACGACATCGTGTCAAAGGTTGGCAACAGTACGCTACGGCGTA GGCCTGACGTGCTTGGTGGGCTCCCTCGTCATGAGTGGTTTTACGAGCGCATCGCCAATACAGCCTCGCACTGGT ACAAGACGATGCGTTGTGTCATTTGTAGGATTCCTCCCATTCCGAGAGAACGCACGGCACCGTGACTGGACACAT CTTATGCACATATATCAGCACCTGCACCTACAGTCTATGTTTAGTTTCAAATGTTTCTAGGTATCCATCGGGTGT ACATTCTCAGTCCTGCTGCGATGTACTCCTGTTTGAACCACCCGCTCGTGCCAAGGTTATGTAGCCATTGTCCGG CCATATCGCTCGTACTGTTATTCACCCATAACGTTTCCAGTCCGTTTGTTCGACTACCTATGATATATGATCTAT CGTACACGGTGTTCTCGCTCATGAACTAGTGGCCTTTTTATCTCGTAATTCAACACTCCCATTGCACCTC |
Length | 1495 |
Sequence id | CopciAB_365333.T0 |
---|---|
Sequence |
>CopciAB_365333.T0 ATCTCACTTTGAACACACTGTTGACGGACACCCGAGTCATGGGTGTTTTCGACGAACTTGGTCGATCCGAGGTCT ATTGGAGAGATCATTATGAATGGTTCAAGGAGCAGGGGTTTGAACTTCGAGCCCGCTATAAACCAGGGTGGATTC CCTCTTGGAAAACAGACCCCACCTTGAAGCCGGGGCTCAGCGAGGATTCGGAAATGTTCAATGTACGTTCCCTGC TCTTTCATTTCAGTGTAGTTTACGGCTAAAACGTTTCACTTCAAGCGCAGCCACCTCAACGATGCTACCCGAATC GCCGACGGCAAGCACGTCGTTTTAAAACGAATCGAAAAGTCTCAATATCCAGAAGAAGTGTCTATCCTCAGGTAT TTCTCAGAAAAACCACTTGCTTCCAACCCAGAGAACCATTGTGTTCCTGTTCTGGCGGTCTTGAACCCTCCTGAC GACCCCGAGCACGACATTGCTGTCCTACCGATCTTACGGGATTACGACGACCCTCCTTTCGAAACCATTGGTGAG GTGGTCGACTACATCGGGCAGATTCTAGAGGTACACAGACGCAGACACAATGATTAGACACCCTTGTCCTGACCT CCGTTTTCTCCAGGGATTCGTGTTCCTCCACGAACATCGTGTTGCACATCGGTCCGTGTCAGTACTCCTTGCGAG AAAGCGCCCACTAACTCCTCCAATATTCAGAGATGTCCGAAGGGACAACATCATGATGGACCCTCATGCCATGGG CCACAGTTCATGGCATTTTGTCTGCCCCGAAAAGACGCGCGACTACAGGTCAGAAGTTACTCACAAGTACACGCG CACCGAGCGTAGGCCAAGGTATTATATCATTGACTTTGGGTACTCTGCCCAGTTCAAACCCGAGGAGATGCCGCC GTCGACTCTGCCAAAACCGGCCAGCGACACCAGCCTTCCTGAATATAACAATCTATGGAAGCCGTGCGATCCATT TCCGATCGATGTGTATGTCGTAGGAAATATGATTCGTATGGACTTTTTGGATGTAGGGGTTGCTTTCTTTCCTTA ATCATTGTTTCTCAAATCCCTGATCCATCCCCGTTCACCAGGGCTACCCGAAGGAAGGTTTCCTCAGCTATCGCC ATTGCGAGAAGATGCCCAGCACAAAACGCCTTGAGTTTCTTCGACCGTTAATAGACGCGATGATTAAGGAGAACC CGAACGAAAGGGTCACGATGAAGGAGGCATTCTCTCTCTTTAACGACATCGTGTCAAAGGTTGGCAACAGTACGC TACGGCGTAGGCCTGACGTGCTTGGTGGGCTCCCTCGTCATGAGTGGTTTTACGAGCGCATCGCCAATACAGCCT CGCACTGGTACAAGACGATGCGTTGTGTCATTTGTAGGATTCCTCCCATTCCGAGAGAACGCACGGCACCGTGAC TGGACACATCTTATGCACATATATCAGCACCTGCACCTACAGTCTATGTTTAGTTTCAAATGTTTCTAGGTATCC ATCGGGTGTACATTCTCAGTCCTGCTGCGATGTACTCCTGTTTGAACCACCCGCTCGTGCCAAGGTTATGTAGCC ATTGTCCGGCCATATCGCTCGTACTGTTATTCACCCATAACGTTTCCAGTCCGTTTGTTCGACTACCTATGATAT ATGATCTATCGTACACGGTGTTCTCGCTCATGAACTAGTGGCCTTTTTATCTCGTAATTCAACACTCCCATTGCA CCTC |
Length | 1729 |