| Systematic name | CopciAB_429744 | Strain | Coprinopsis cinerea Okayama 7 |
|---|---|---|---|
| Standard name | tmk1 | Synonyms | 429744 |
| Uniprot id | Functional description | CMGC MAPK protein kinase | |
| Location | scaffold_1:2430502..2432250 | Strand | - |
| Gene length (nt) | 1749 | Transcript length (nt) | 1207 |
| CDS length (nt) | 1092 | Protein length (aa) | 363 |
| Strain name | Gene / Protein name |
|---|---|
| Strain name | Gene / Protein name | Pident | E-value | Bits |
|---|---|---|---|---|
| Hypsizygus marmoreus strain 51987-8 | Hypma_RDB29560 | 94.4 | 2.101E-236 | 722 |
| Agrocybe aegerita | Agrae_CAA7266567 | 91 | 1.01E-234 | 717 |
| Pleurotus eryngii ATCC 90797 | Pleery1_1441362 | 92.5 | 1.171E-232 | 711 |
| Pleurotus ostreatus PC15 | PleosPC15_2_1053841 | 92.5 | 9.959E-233 | 711 |
| Pleurotus ostreatus PC9 | PleosPC9_1_53880 | 92.5 | 9.748E-233 | 711 |
| Flammulina velutipes | Flave_chr08AA00827 | 90.9 | 1.865E-226 | 693 |
| Lentinula edodes NBRC 111202 | Lenedo1_263629 | 87.7 | 4.215E-218 | 669 |
| Lentinula edodes W1-26 v1.0 | Lentinedodes1_2340 | 87.7 | 4.182E-218 | 669 |
| Lentinula edodes B17 | Lened_B_1_1_2210 | 87.8 | 1.543E-209 | 644 |
| Ganoderma sp. 10597 SS1 v1.0 | Gansp1_113395 | 83.1 | 5.23E-206 | 634 |
| Grifola frondosa | Grifr_OBZ79590 | 83.3 | 2.824E-204 | 629 |
| Name | Summary | Attribution | Assay type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Carbon metabolism | Transcriptional changes along alternative morphogenetic paths of C. cinerea | Xie et al. 2020 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Complex carbon sources 1 (long incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Coprinopsis challenged with bacteria | Transcriptional response to Bacillus subtilis and Escherichia coli. | Kombrink et al. 2018 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Early development 1 | Time series expression profiling of basidiospore and oidium germination | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Early development 2 | Time series expression profiling of mycelial growth, light induction and fruiting body initiation. | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Fruiting body development | RNA-Seq analysis of fruiting body development | Krizsan et al. 2019 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Nitrogen sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Plant biomass (12h incubation) | Expression profiling on diverse plant biomasses as carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Simple and complex carbon and nitrogen sources | Expression profiling on diverse complex carbon and nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Simple and complex carbon sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Starvation induced by water agar transfer | Expression profiling on starvation induced by transfer to water agar | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Straw time series | Time series expression profiling on straw as a carbon source | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Stress conditions 1 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Stress conditions 2 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Systematic name | tmk1 |
|---|---|
| Protein id | CopciAB_429744.T0 |
| Description | CMGC MAPK protein kinase |
| Analysis | Signature accession | Signature description | InterPro Accession | Start | End |
|---|---|---|---|---|---|
| CDD | cd07849 | STKc_ERK1_2_like | - | 13 | 358 |
| Pfam | PF00069 | Protein kinase domain | IPR000719 | 19 | 314 |
| Prediction | Start | End | Score |
|---|---|---|---|
| No records | |||
| Domain n | Start | End | Length |
|---|---|---|---|
| No records | |||
| Accession | Description |
|---|---|
| IPR017441 | Protein kinase, ATP binding site |
| IPR008271 | Serine/threonine-protein kinase, active site |
| IPR003527 | Mitogen-activated protein (MAP) kinase, conserved site |
| IPR000719 | Protein kinase domain |
| IPR011009 | Protein kinase-like domain superfamily |
| Go id | Term | Ontology |
|---|---|---|
| GO:0005524 | ATP binding | MF |
| GO:0004672 | protein kinase activity | MF |
| GO:0006468 | protein phosphorylation | BP |
| GO:0004707 | MAP kinase activity | MF |
| KEGG Orthology |
|---|
| K04371 |
| COG category | Description |
|---|---|
| T | CMGC MAPK protein kinase |
| Class | Family | Subfamily |
|---|---|---|
| No records | ||
| Group |
|---|
| No records |
Arrow shows the origin of gene family containing CopciAB_429744.
| Sequence id | CopciAB_429744.T0 |
|---|---|
| Sequence |
>CopciAB_429744.T0 MSSRRNAKPLPKFEIGDDYQLLHAIGEGAYGTVAAALHKPTGRQVAIKKVLPFDHTLFCLRTLRELKLLKFFSET CVNENIISILDIIKPPSLEEFKEIYFIQELMQTDLHRVIRTQHLTDDHCQYFVYQTLRALKSIHSADIVHRDLKP ANLLLNANCDLKVCDFGLARSVKTSVPAGKEVGLMTEYVATRWYRAPEIMLSFKMYTKAIDIWAVGCILAELLTG RPLFPGRDYSHQLDLILDVIGTPSLDEFYAITSRRSRDYIRALPIRKKRPFPTLFPHASQEAIDFLTKTLTFDPK KRMTVDEALEHPYLAAYHDPEDEPVVTPLSPDYFEFDMHKDDLSKDQLKELLYQEVLSFTPSI |
| Length | 363 |
| Sequence id | CopciAB_429744.T0 |
|---|---|
| Sequence |
>CopciAB_429744.T0 ATGTCTTCTCGTAGGAACGCAAAACCTCTCCCAAAGTTCGAAATCGGTGACGATTATCAGCTACTGCATGCGATT GGAGAAGGCGCATACGGGACAGTCGCTGCTGCTCTTCACAAGCCGACAGGGCGCCAGGTCGCCATAAAGAAAGTC CTCCCTTTCGACCATACATTGTTTTGCCTCCGAACCCTTCGAGAGCTCAAGTTGCTCAAGTTCTTCTCGGAGACT TGCGTCAACGAAAATATTATTTCAATCCTGGATATTATCAAGCCTCCTTCCCTTGAAGAGTTCAAGGAGATATAC TTTATCCAGGAATTGATGCAGACTGACTTGCACCGTGTTATCCGTACTCAGCACCTCACGGACGACCACTGCCAA TACTTCGTTTACCAAACACTCCGGGCGCTCAAATCAATCCACAGCGCCGACATCGTCCACCGTGACCTCAAACCT GCTAACCTTCTTCTCAATGCCAATTGTGACCTGAAGGTTTGTGACTTTGGCCTGGCTCGCAGCGTGAAGACCAGC GTCCCCGCCGGGAAAGAAGTCGGTTTGATGACGGAGTACGTCGCCACTCGGTGGTACCGCGCTCCCGAGATCATG TTGTCCTTCAAGATGTACACCAAGGCAATTGACATCTGGGCTGTGGGCTGTATTCTTGCCGAACTTCTCACTGGA AGGCCCTTGTTCCCGGGTCGTGATTACAGCCATCAACTCGACCTGATCCTCGATGTGATTGGCACGCCCAGTCTC GATGAGTTCTATGCTATTACTTCGCGGAGGTCTCGCGACTATATTCGTGCACTTCCCATCCGCAAGAAACGCCCT TTCCCCACACTTTTCCCGCACGCCTCGCAGGAAGCTATCGATTTCTTAACCAAGACCTTGACCTTTGATCCAAAG AAACGAATGACTGTGGACGAGGCCTTGGAGCACCCTTATCTCGCGGCTTATCACGACCCCGAAGATGAGCCTGTC GTGACACCCCTTAGCCCGGACTACTTCGAATTCGACATGCACAAGGACGATCTCAGCAAAGACCAGCTGAAAGAG CTCCTCTACCAGGAAGTTTTGTCTTTCACCCCTTCTATCTAG |
| Length | 1092 |
| Sequence id | CopciAB_429744.T0 |
|---|---|
| Sequence |
>CopciAB_429744.T0 AAGTCCCTCATCGACCATCCCCCGGTGGGTTTCTGGTGTACTAAGAATGTCTTCTCGTAGGAACGCAAAACCTCT CCCAAAGTTCGAAATCGGTGACGATTATCAGCTACTGCATGCGATTGGAGAAGGCGCATACGGGACAGTCGCTGC TGCTCTTCACAAGCCGACAGGGCGCCAGGTCGCCATAAAGAAAGTCCTCCCTTTCGACCATACATTGTTTTGCCT CCGAACCCTTCGAGAGCTCAAGTTGCTCAAGTTCTTCTCGGAGACTTGCGTCAACGAAAATATTATTTCAATCCT GGATATTATCAAGCCTCCTTCCCTTGAAGAGTTCAAGGAGATATACTTTATCCAGGAATTGATGCAGACTGACTT GCACCGTGTTATCCGTACTCAGCACCTCACGGACGACCACTGCCAATACTTCGTTTACCAAACACTCCGGGCGCT CAAATCAATCCACAGCGCCGACATCGTCCACCGTGACCTCAAACCTGCTAACCTTCTTCTCAATGCCAATTGTGA CCTGAAGGTTTGTGACTTTGGCCTGGCTCGCAGCGTGAAGACCAGCGTCCCCGCCGGGAAAGAAGTCGGTTTGAT GACGGAGTACGTCGCCACTCGGTGGTACCGCGCTCCCGAGATCATGTTGTCCTTCAAGATGTACACCAAGGCAAT TGACATCTGGGCTGTGGGCTGTATTCTTGCCGAACTTCTCACTGGAAGGCCCTTGTTCCCGGGTCGTGATTACAG CCATCAACTCGACCTGATCCTCGATGTGATTGGCACGCCCAGTCTCGATGAGTTCTATGCTATTACTTCGCGGAG GTCTCGCGACTATATTCGTGCACTTCCCATCCGCAAGAAACGCCCTTTCCCCACACTTTTCCCGCACGCCTCGCA GGAAGCTATCGATTTCTTAACCAAGACCTTGACCTTTGATCCAAAGAAACGAATGACTGTGGACGAGGCCTTGGA GCACCCTTATCTCGCGGCTTATCACGACCCCGAAGATGAGCCTGTCGTGACACCCCTTAGCCCGGACTACTTCGA ATTCGACATGCACAAGGACGATCTCAGCAAAGACCAGCTGAAAGAGCTCCTCTACCAGGAAGTTTTGTCTTTCAC CCCTTCTATCTAGGACATGTTCTCTGTACTGCATCTAATGATTGCTGTGATATATACATCGATAATTGTATTTGA ATACCGG |
| Length | 1207 |
| Sequence id | CopciAB_429744.T0 |
|---|---|
| Sequence |
>CopciAB_429744.T0 AAGTCCCTCATCGACCATCCCCCGGTGGGTTTCTGGTGTACTAAGAATGTCTTCTCGTAGGAACGCAAAACCTCT CCCAAAGTTCGAAATCGGTACGGCTATCTCCTCCACAATCTGGTACATCGCTTCACCGCCCATATTTACTAGGTG ACGATTATCAGCTACTGCATGCGATTGGAGAAGGCGCATACGGGACAGTCGCTGCTGCTCTTCACAAGCCGACAG GGCGCCAGGTCGCCATAAAGAAAGTCCTCCCTTTCGACCATACATTGTTTTGCCTCCGAACCCTTCGAGAGCTCA AGTTGCTCAAGTTCTTCTCGGAGACTTGCGTCAACGAAAATGTAGATCCAGCTCCATCGTGCACCCTGTTACCTG CTGATGGCTTGCCAGATTATTTCAATCCTGGATATTATCAAGCCTCCTTCCCTTGAAGAGTTCAAGGAGATATAC TGTAAGCTCGACGCCCGTACATCGTCCCTCAGTTCCGATTCCATGCCTTCCCTCAGTTATCCAGGAATTGATGCA GACTGACTTGCACCGTGTTATCCGTACTCAGCACCTCACGGACGACCACTGCCAAGTATGTCGCTTTCAATGACC CGTTCTCAATACACTACTGACCGTCTGTGTAGTACTTCGTTTACCAAACACTCCGGGCGCTCAAATCAATCCACA GCGCCGACATCGTCCACCGTGACCTCAAACCTGCTAACCTTCTTCTCAATGCCAATTGTGACCTGAAGGTTTGTG ACTTTGGCCTGGCTCGCAGCGTGAAGACCAGCGTCCCCGCCGGGAAAGAAGTCGGTTTGATGACGGAGTACGTCG CCACTCGGTGGTACCGCGCTCCCGAGATCATGTTGTCCTTCAAGATGTACACCAAGGTAGGCGCCAGAAGTACGT GTCGTTGCTCCCGCTGGCTGAAATGTTGCCTAGGCAATTGACATCTGGGCTGTGGGCTGTATTCTTGCCGAACTT CTCACTGGAAGGCCCTTGTTCCCGGGTCGTGATTACAGCCATCAACTCGACCTGATCCTCGATGTGATTGGTTAG TTTTGCACGTTCTTTTGTCTCAAGATGGGATGTGCTAATTCCTATGCAGGCACGCCCAGTCTCGATGAGTTCTAT GCTATTACTTCGCGGAGGTCTCGCGACTATATTCGTGCACTTCCCATCCGCAAGAAACGCCCTTTCCCCACACTT TTCCCGCACGCCTCGCAGGAAGCTATCGATTTCTTAACCAAGACCTTGGTCAGTGCCCATTACCACGATAATATA TTGCAAATCGTATTTACACGCCATTCACCCTGCAGACCTTTGATCCAAAGAAACGAATGACTGTGGACGAGGCCT TGGAGCACCCTTATCTCGCGGCTTATGTACGTATTGATCGACCTTCCTGTCGATCCTGCAGGACCCTGATCAAAA TCTAGCACGACCCCGAAGATGAGCCTGTCGTGACACCCCTTAGCCCGGACTACTTCGAATTCGACAGTAAGTCTT TGCGAGTGGCAAGCTATACGCTGACTTTGACACCTCTCGTCATCAGTGCACAAGGACGATCTCAGCAAAGACCAG CTGAAAGGTGCGCGCGAGTTCGACATACCATCCACTGCTGCGTAACTGACCCCCCGAGTAGAGCTCCTCTACCAG GAAGTTTTGTCTTTCACCCCTTCTATCTAGGACATGTTCTCTGTACTGCATCTAATGATTGCTGTGATATATACA TCGATAATTGTATTTGAATACCGG |
| Length | 1749 |