Systematic name | CopciAB_436904 | Strain | Coprinopsis cinerea Okayama 7 |
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Standard name | - | Synonyms | 436904 |
Uniprot id | Functional description | Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase | |
Location | scaffold_2:1687679..1689686 | Strand | + |
Gene length (nt) | 2008 | Transcript length (nt) | 1294 |
CDS length (nt) | 1107 | Protein length (aa) | 368 |
Strain name | Gene / Protein name |
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Schizosaccharomyces pombe | omh1 |
Strain name | Gene / Protein name | Pident | E-value | Bits |
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Agrocybe aegerita | Agrae_CAA7271689 | 59.5 | 7.394E-162 | 507 |
Agaricus bisporus var bisporus (H97) | Agabi_varbisH97_2_183205 | 68.7 | 8.154E-148 | 466 |
Agaricus bisporus var. burnettii JB137-S8 | Agabi_varbur_1_118115 | 68.7 | 8.497E-148 | 466 |
Name | Summary | Attribution | Assay type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Carbon metabolism | Transcriptional changes along alternative morphogenetic paths of C. cinerea | Xie et al. 2020 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Complex carbon sources 1 (long incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Coprinopsis challenged with bacteria | Transcriptional response to Bacillus subtilis and Escherichia coli. | Kombrink et al. 2018 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Early development 1 | Time series expression profiling of basidiospore and oidium germination | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Early development 2 | Time series expression profiling of mycelial growth, light induction and fruiting body initiation. | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Fruiting body development | RNA-Seq analysis of fruiting body development | Krizsan et al. 2019 | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Nitrogen sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Plant biomass (12h incubation) | Expression profiling on diverse plant biomasses as carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Simple and complex carbon and nitrogen sources | Expression profiling on diverse complex carbon and nitrogen sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Simple and complex carbon sources (12h incubation) | Expression profiling on diverse complex carbon sources. | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Starvation induced by water agar transfer | Expression profiling on starvation induced by transfer to water agar | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Straw time series | Time series expression profiling on straw as a carbon source | Hegedus et al. | RNA-Seq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Stress conditions 1 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Stress conditions 2 | Expression profiling under various stress conditions | Hegedus et al. | QuantSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Systematic name | - |
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Protein id | CopciAB_436904.T0 |
Description | Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase |
Analysis | Signature accession | Signature description | InterPro Accession | Start | End |
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Pfam | PF01793 | Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase | IPR002685 | 52 | 328 |
Prediction | Start | End | Score |
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No records |
Domain n | Start | End | Length |
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1 | 13 | 35 | 22 |
Accession | Description |
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IPR002685 | Glycosyl transferase, family 15 |
IPR029044 | Nucleotide-diphospho-sugar transferases |
Go id | Term | Ontology |
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GO:0000030 | mannosyltransferase activity | MF |
GO:0006486 | protein glycosylation | BP |
GO:0016020 | membrane | CC |
KEGG Orthology |
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K10967 |
COG category | Description |
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G | Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferase |
Class | Family | Subfamily |
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GT | GT15 |
Group |
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No records |
Arrow shows the origin of gene family containing CopciAB_436904.
Sequence id | CopciAB_436904.T0 |
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Sequence |
>CopciAB_436904.T0 MSSLSSLQTSSRRRIFLILFAVIIFVTLLSTFLHGQYRQFPQLQQLVNPDLPISIPYRANATFVMLCRNEELQGV LSSIRQIEDRFNRDHDYPWVLLNDKPFDEEFKRRVSVITKAPVHFGFIPPEIWNQPDSIDEERAAAGRAKLKAEG IIYAESVPYRNMCRFNSGFFYRHELLKPYRYYWRVEPNVDYFCNLNYDPFEFMERNNKTYGFTISLLEWHQTIPT LWDSVKEFIEANPQFVHPNNAMNFVSNNGGKTYNQCHFWSNFEIADMDFWRGEAYSKFFDFLEEKGGFYYERWGD APVHSIAVSLFAPKDSIHYFYDIGYRHDSFQHCPSGNTWREGSCSCDPTETFNNRASSCTEKFMVAVR |
Length | 368 |
Sequence id | CopciAB_436904.T0 |
---|---|
Sequence |
>CopciAB_436904.T0 ATGTCGTCTCTCTCCTCCCTTCAAACCTCGTCCAGGAGACGAATATTCTTGATTCTTTTCGCTGTTATCATCTTC GTCACCTTGCTCTCGACTTTTCTCCATGGCCAGTACCGACAATTCCCACAACTTCAACAGCTCGTCAACCCGGAT CTGCCCATTTCAATCCCCTACCGCGCCAATGCGACCTTTGTGATGTTGTGCAGGAACGAAGAACTTCAGGGTGTG CTGTCCAGCATTCGGCAGATCGAAGACCGATTCAACCGAGACCACGACTACCCATGGGTGTTGCTGAACGATAAA CCCTTCGACGAGGAATTCAAGAGGAGAGTTTCAGTCATCACCAAAGCACCCGTTCACTTTGGTTTTATTCCCCCC GAAATATGGAATCAACCGGATTCAATTGACGAGGAACGAGCGGCGGCTGGTCGAGCCAAACTCAAGGCTGAGGGT ATCATCTATGCTGAGAGCGTCCCGTATCGGAATATGTGCCGATTCAATTCGGGGTTTTTCTATCGACATGAACTC TTGAAGCCCTACCGCTACTACTGGAGGGTTGAACCAAACGTCGACTACTTCTGCAACCTCAACTATGACCCCTTC GAGTTTATGGAGAGGAATAACAAGACCTACGGCTTCACAATCTCGCTACTTGAGTGGCATCAGACTATTCCGACG CTATGGGACTCCGTGAAAGAATTTATCGAGGCCAATCCTCAATTCGTTCACCCTAACAACGCCATGAATTTCGTT TCGAATAACGGAGGAAAGACGTATAACCAATGCCACTTCTGGAGCAACTTTGAGATAGCCGATATGGACTTTTGG AGAGGGGAAGCCTACTCCAAGTTTTTCGATTTTCTAGAAGAAAAGGGTGGGTTTTACTATGAGCGATGGGGAGAC GCTCCAGTGCACAGTATCGCAGTTTCGTTGTTTGCCCCAAAGGACAGCATCCACTACTTCTACGATATCGGATAT AGACACGATTCGTTCCAACATTGCCCATCCGGGAACACCTGGCGTGAAGGAAGCTGCTCGTGTGATCCCACTGAA ACATTCAACAACCGCGCCTCCTCGTGCACAGAAAAGTTCATGGTTGCCGTTCGGTGA |
Length | 1107 |
Sequence id | CopciAB_436904.T0 |
---|---|
Sequence |
>CopciAB_436904.T0 GTCCTTCTTGACCCTGAATCGTCTTCTCTTCTTCCTTTCTGCATGTCGTCTCTCTCCTCCCTTCAAACCTCGTCC AGGAGACGAATATTCTTGATTCTTTTCGCTGTTATCATCTTCGTCACCTTGCTCTCGACTTTTCTCCATGGCCAG TACCGACAATTCCCACAACTTCAACAGCTCGTCAACCCGGATCTGCCCATTTCAATCCCCTACCGCGCCAATGCG ACCTTTGTGATGTTGTGCAGGAACGAAGAACTTCAGGGTGTGCTGTCCAGCATTCGGCAGATCGAAGACCGATTC AACCGAGACCACGACTACCCATGGGTGTTGCTGAACGATAAACCCTTCGACGAGGAATTCAAGAGGAGAGTTTCA GTCATCACCAAAGCACCCGTTCACTTTGGTTTTATTCCCCCCGAAATATGGAATCAACCGGATTCAATTGACGAG GAACGAGCGGCGGCTGGTCGAGCCAAACTCAAGGCTGAGGGTATCATCTATGCTGAGAGCGTCCCGTATCGGAAT ATGTGCCGATTCAATTCGGGGTTTTTCTATCGACATGAACTCTTGAAGCCCTACCGCTACTACTGGAGGGTTGAA CCAAACGTCGACTACTTCTGCAACCTCAACTATGACCCCTTCGAGTTTATGGAGAGGAATAACAAGACCTACGGC TTCACAATCTCGCTACTTGAGTGGCATCAGACTATTCCGACGCTATGGGACTCCGTGAAAGAATTTATCGAGGCC AATCCTCAATTCGTTCACCCTAACAACGCCATGAATTTCGTTTCGAATAACGGAGGAAAGACGTATAACCAATGC CACTTCTGGAGCAACTTTGAGATAGCCGATATGGACTTTTGGAGAGGGGAAGCCTACTCCAAGTTTTTCGATTTT CTAGAAGAAAAGGGTGGGTTTTACTATGAGCGATGGGGAGACGCTCCAGTGCACAGTATCGCAGTTTCGTTGTTT GCCCCAAAGGACAGCATCCACTACTTCTACGATATCGGATATAGACACGATTCGTTCCAACATTGCCCATCCGGG AACACCTGGCGTGAAGGAAGCTGCTCGTGTGATCCCACTGAAACATTCAACAACCGCGCCTCCTCGTGCACAGAA AAGTTCATGGTTGCCGTTCGGTGATAGAGATGACGAGGGAAAACCGCGATGATATACTAGATACCGTCATGCTCA ATGGTCCGGTAGCGTTGAACCTGAGGCTATCTAGAGCCTGCTAGGATCCCATTTTTGGAGATACCGCGACCAATT TCATGAATCTATGCCTACC |
Length | 1294 |
Sequence id | CopciAB_436904.T0 |
---|---|
Sequence |
>CopciAB_436904.T0 GTCCTTCTTGACCCTGAATCGTCTTCTCTTCTTCCTTTCTGCATGTCGTCTCTCTCCTCCCTTCAAACCTCGTCC AGGAGACGAATATTCTTGATTCTTTTCGCTGTTATCGTGCGTGTCTCCCTGCCTCCAGGTGTCCTCTTACCACTT CCCTTACATGTCGATCATTCCTCAAGATCTTCGTCACCTTGCTCTCGACTTTTCTCCATGGCCAGTACCGACAAT TCCCACAACTTCAACAGCTCGTCAACCCGGATCTGCCCATTTCAATCCCCTACCGCGCCAATGCGACCTTTGTGA TGTTGTGCAGGAACGAAGAACTTCAGGGTGTGCTGTCCAGCATTCGGCAGATCGAAGACCGATTCAACCGAGACC ACGACTACCCATGGGTGTTGCTGAACGATAAACCCTTCGACGAGGAATTCAAGAGGTGCGTCAACATCCGCCGCG CGGTTGCCTCGTTTCACCGTCCACTCATTCCGTCGGTTGGTTGAGCAGGAGAGTTTCAGTCATCACCAAAGCACC CGTTCACTTTGGTTTTATTCCCCCCGAAATATGGAATCAACCGGATTCAATTGACGAGGAACGAGCGGCGGCTGG TCGAGCCAAACTCAAGGCTGAGGGTATCATCTATGCTGGTGCGTCGTCTCTCCGTGAACTCCCAAAAAACACGAA CTGAGGAACGCTCGACCTGTTCATATCGTTGCCATAGAGAGCGTCCCGTGAGTTCATCATTAATCTCTCGTGTCT CAGCTGGATTCAATTCTGATGACGCTATGCTTCTTCAAGGTATCGGAATATGTGCCGATTCAATTCGGGGGTAAG AACATTCTTGATGGATGACGTTGAAGCTTGTTGACCCCGGTGCCTGCTGGCCATGTATAGTTTTTCTATCGACAT GAACTCTTGAAGCCCTACCGCTACTACTGGAGGTAATACGTTCGTTACCTGCCACGTCAACTGCAACTGACCCAT TTGATCTTTAGGGTTGAGTATGTGCTATTGTTGAGCCATAATCAGTGCACCTCTTTAACGTCCTCTTCCAGACCA AACGTCGACTACTTCTGCAACCTCAACTATGACCCCTTCGAGTTTATGGAGAGGAATAACAAGACCTACGGTAGC CGCGGATTTTCGTTACGACGATCGCCCGCTCATTCAATTGACTAGGCTTCACAATCTCGCTACTTGAGTGGCATC AGACTATTCCGACGCTATGGGACTCCGTGAAAGGTAAACGATCGGCGTTCTCTATCCCCCTAGACATCTCTAACG ATCCAGTAATAGAATTTATCGAGGCCAATCCTCAATTCGTTCACCCTAACAACGCCATGAATTTCGTTTCGAATA ACGGAGGAAAGACGTATAACCAATGCCACTGTACGTACCATCCGTCTCCCTTCTCCACAGTTGCTAATCGACGCC TAGTCTGGAGCAACTTTGAGATAGCCGATATGGACTTTTGGAGAGGGGAAGCCTACTCCAAGTTTTTCGATTTTC TAGAAGAAAAGGGTGGGTTTTACTATGAGGTAAGTAAACCCCATACTTTGCGGATGATCGAGCTAGCCACTCACT GGTGCCGGAAATCAGCGATGGGGAGACGCTCCAGTGCACAGTATCGCAGTTTCGTTGTTTGCCCCAAAGGACAGC ATCCACTACTTCTACGATATCGGATATAGACACGATTCGTTCCAACATTGCCCATCCGGGAACACCTGGCGTGAA GGAAGCTGCTCGTGTGATCCCACTGAAACATTCAGTAAGTCTGTATCTTTATTCAAACGGCAACAGATGCACTGA TGCGATGGACAAGACAACCGCGCCTCCTCGTGCACAGAAAAGTTCATGGTTGCCGTTCGGTGATAGAGATGACGA GGGAAAACCGCGATGATATACTAGATACCGTCATGCTCAATGGTCCGGTAGCGTTGAACCTGAGGCTATCTAGAG CCTGCTAGGATCCCATTTTTGGAGATACCGCGACCAATTTCATGAATCTATGCCTACC |
Length | 2008 |